균류에 따라 차이는 있으나 관수량을 줄이고 토양의 통기성을 확보하며 거름 시비를 줄이면 버섯 생성이 잦아들 수 있다. 버섯이 많지 않다면 제거하는 것만으로도 더 이상의 큰 문제는 생기지 않도록 할 수 있다.

버섯은 유기물이 많을수록, 혹은 완전히 발효되지 않은 유기물이나 우드칩을 사용할 경우 발생할 수 있는 문제이다. 따라서 안정적인 식물 생육을 위해 완전 발효된 적정량의 유기물을 사용하는 것이 좋다.